在 Undertale 中，有四種不同的主要結局，分別為中立結局、完美結局、屠殺結局和困難模式結局。
中立路線
關於更多資訊，請見中立路線。
中立結局條件：
主角並未與某些重要角色(Papyrus、Undyne、Alphys)成為朋友。
未探索真正的實驗室。
主角殺了部分怪物，但並未全部殺光。
中立路線以主角獨自逃離地下世界而結束。根據整個遊戲過程中所做的選擇，此結局可能會有多種不同的變化。
完美路線
關於更多資訊，請見完美路線。
完美結局條件：
完成一次中立結局。
遊戲過程中沒有殺掉任何一隻怪物(不能獲得任何 EXP，LV 必須保持1)。
與 Papyrus、Undyne 及 Alphys 成為朋友。
探索過真正的實驗室。
完美結局中，結界被破壞，而主角與所有怪物都能離開地下世界。此外還會出現完美結局致謝名單。
屠殺路線
關於更多資訊，請見屠殺路線。
屠殺結局條件：
殺掉地下世界，如廢墟、雪町、瀑布、熱地和核心的所有怪物和頭目，不留任何活口。
完成屠殺路線會導致遊戲世界的破壞。到達屠殺結局並重新載入遊戲時，第一個人類會問主角要不要放棄自己的靈魂來換取整個世界的重生。
困難模式
關於更多資訊，請見困難模式。
當為墜落的人類命名"Frisk"時可開啟困難模式。困難模式除了難度增強外，也包含對話改變和更困難的怪物遭遇戰。困難模式僅持續到廢墟結束，類似於"Undertale 展示版"。當完成與 Toriel 的戰鬥後，煩人的狗會出現並宣布困難模式結束。